2021年承担课题
1. 水稻转录因子RFM4对稻瘟病抗性的调控机制，国家自然科学基金面上项目（32172419），李伟滔，主持，2022---2025。
2. 转录因子FOT1调控水稻花时的分子机制及应用研究，国家自然科学基金面上项目（3217150602），孙昌辉，主持，2022---2025。
3. CLAVATA家族类受体蛋白激酶SDV1调控水稻株高的分子机理及育种应用，国家自然科学基金面上项目（32171966），李双成，主持，2022---2025。
4. Chalk10调控水稻垩白形成的分子机制及育种利用，国家自然科学基金面上项目（32172023），涂斌，主持，2022---2026。
5. 天府万人计划-天府杰出科学家，李仕贵，主持。
6. 农业科研杰出人才培养计划，农业农村部，钦鹏，主持，2021---2025。
7. 杂交稻新品种关键栽培技术创新与应用，四川省科技厅项目，孙永健，主持，2021---2025。
8. 水稻种质资源的收集保存、鉴定发掘与种质创新，四川省科技厅项目，徐培洲，参与，2021---2025。
9. 十四五育种攻关项目，四川省科技厅，李双成，主持，2021---2025。
10. 优异基因及资源发掘与利用研究，四川省科技计划重点研发项目子课题（2021YFYZ0016），钦鹏，主持，2021。
11. 绿色高效超级稻品种培育，四川省重大科技专项（申请号:22ZDZX0006），李仕贵，主持，2022---2026。
12. 川渝地区耐高温高湿优异水稻种质、基因资源挖掘和育种应用研究，四川省区域创新合作重点研发项目（申请号:22QYCX0057），马炳田，主持，2022---2023。
13. 四川省辐射技术诱变育种平台，四川省重点研发项目（2021YFYZ0011），朱建清，主持，2021---2025。
14. 富硒水稻硒蛋白提取、纯化及生物活性研究，四川省科技厅国际合作项目： 2021YFH0085 ，李利华，主持，2021.4---2023.3。
15. 强优势超级水稻杂交种创制与应用研究，省育种攻关，吴先军，主持，2021---2025。
16. 四川省“十四五”育种攻关农作物新品种区域试验，马均、孙永健、杨志远，主持。
17. 四川省水稻创新团队，马均，主持。
18. 四川省科技万里行，马均、孙永健，主持。
19. 省种子站水稻区试稻米品鉴，马均，主持。
20. 四川省农科院水稻高粱所，培训培养费，徐培洲，主持，2021---2022。
21. 2021年省农业公共安全与资源保护——水稻区域试验，王玉平，主持，2021。
22. 2021年四川省现代农业发展工程——种质资源鉴定，王玉平，主持，2021。
23. 四川省2021-2023年“三区”人才支持计划科技人员专项计划，钦鹏，主持，2021---2023。
24. SG3蛋白调控水稻四川省水稻提质高效集成技术推广应用株型和粒型的分子生物学功能研究，四川省农业农村厅项目，孙永健，主持，2021。
25. 荣县水稻提质高效集成技术推广应用，四川省农业农村厅项目，杨志远，主持，2021。
26. 巴中市粮油产业全面发展关键技术集成研究，李仕贵，主持，2021---2023。
27. 巴斯马蒂型优质杂交水稻选育与试验示范，成都市科技项目（2021-YF05-02090-SN），廖泳祥，主持，2021.08---2022.07。
28. 绿色高产高效水稻新品种培育及推广示范，成都市科技局项目，徐培洲，参与，2021---2022。
29. 酿造米酒专用有色水稻深加工及产业化研发，成都市科技局项目，陈晓琼，主持，2021---2022。
30. 水稻新品种培育和绿色高效生产技术集成研究及应用示范，成都市科技局重大科技应用示范项目（立项编号2021-YF09-00066-SN），李仕贵，主持，2021---2023。
31. 水稻抽穗期耐高温基因DSHT2的分子机制和应用研究，杂交水稻国家重点实验室开放课题，陈薇兰，主持，2021---2021。
32. 温江万春镇高山村水稻科技成果示范推广，温江农业农村局，朱军，主持，2021.05---2021.11。
33. 天全“十八道水香稻”品种定向改良及其绿色生产技术集成研究，天全科技局，朱军，主持，2021---2022。
34. “一带一路”农科教研究中心，四川农业大学国际化办学条件支撑专项经费，朱建清，主持，2021。
2020年承担课题
1. DSHT1调控高温影响水稻结实的分子机制和应用研究，国家自然科学基金面上项目，钦鹏，主持，2021---2024。
2. 胞质类受体激酶OsShBR5调控水稻纹枯病抗性的分子机制，国家自然科学基金面上项目，李平，主持，2020---2023。
3. 水稻抽穗期耐高温基因DSHT2分子机制和应用研究，国家自然科学基金面上项目，李仕贵，主持，2020---2023。
4. DUF类新基因STS1及其互作蛋白调控水稻花粉发育的分子机制，国家自然科学基金面上项目，李双成，主持，2020---2023。
5. 分支酸合成相关基因Ecbp1对bsr-d1介导稻瘟病抗性的调控机制，国家自然科学基金面上项目，李伟滔，主持，2020---2023。
6. RUB1基因调控水稻穗上部枝梗发育的分子机制，国家自然科学基金面上项目，王平荣，主持，2020---2023。
7. 水稻雄性发育相关基因TP1的克隆及其影响花药和花粉发育的机制，国家自然科学基金青年项目，邹挺，主持，2020---2022。
8. NBS-LRR抗病蛋白OsnTNB.11调控水稻稻粒黑粉病抗性的分子机制，国家自然科学基金青年项目，王爱军，主持，2021---2023。
9. 水稻转录因子基因Myb1调控稻瘟病广谱抗性的机制，国家教育部霍英东基金，李伟滔，主持，2020---2023。
10. 基于国窖红高粱的酿酒原料栽培繁育体系构建及杂交提纯品系选育，国家固态酿造工程技术研究中心开放课题，朱建清，主持，2020---2022。
11. 四川省水稻绿色提质高效配套技术推广应用，农村农业部，孙永健，主持，2021---2021。
12. 四川省水稻提质高效集成技术推广应用，四川省协同推广计划，杨志远，主持，2021---2021。
13. 丙酮酸激酶OsPK7调控水稻灌浆与品质的分子机制研究，四川省科技厅，涂斌，主持，2021---2023 。
14. 高端香型优质稻低温烘干、恒温储存及冷链物流技术集成与示范，四川省科技厅重点研发，邓其明，主持，2021---2024。
15. 米酒酿造型水稻培育及其全产业链产业技术研究（创新能力培育），四川省科技厅重点研发，朱军，主持，2021---2022。
16. 主要农作物及畜禽良种扩繁和种子加工关键技术，四川省科技厅重点研发，王玉平，主研，2020---2023。
17. 四川丘区优质稻种植、加工、包装及冷链储存物流全产业链技术集成与产业化示范，四川省科技厅重点研发，邓其明，主持，2020---2022。
18. 香型糯稻品种开发及其速冻汤圆生产关键技术研究，四川省科技厅重点研发，朱军，主持，2020---2022。
19. 水肥“三匀”模式下稻田水、氮运移对水稻根系生长分布的影响，四川省科技厅应用基础，杨志远，主持，2021---2023。
20. 水稻抽穗期耐高温优异等位基因挖掘和分子机制解析，四川省科技厅应用基础，钦鹏，主持，2020---2022。
21. 稻米垩白形成过程中的水氮耦合调控作用及机理，四川省科技厅应用基础，孙永健，主持，2020---2022。
22. 水稻龙须谷低温诱导基因OsLTI1功能研究，四川省科技厅应用基础，徐正君，主持，2020---2022。
23. 酪蛋白激酶DTG1调控水稻分蘖的分子机制，四川省科技厅应用基础，梁越洋，主持，2020---2021。
24. 水稻早花时基因L15的分子机制解析及应用探索，四川省科技厅应用基础，孙昌辉，主持，2020---2021。
25. 水稻富硒蛋白胶囊工艺技术研究，四川省科技厅国际合作，刘尧，主持，2020---2022。
26. 富硒GABA留胚大米加工技术研究，四川省科技厅国际合作，王爱军，主持，2020---2022。
27. 克拉玛依富硒水稻节水高产生产技术与产业化开发，四川省科技厅区域创新合作，朱建清，主研，2020---2022。
28. 乌蒙山区生态保健型水稻生产体系建立和推广（面上项目），四川省科技厅科技扶贫专项，朱军，主研，2020---2021。
29. 高端优质广适性杂交稻模块化分子设计育种与应用示范，成都市科技局重大科技应用示范项目，梁越洋，主持，2020---2022。
30. 影响水稻雄性发育新基因LSP2的克隆及功能研究，其他省市项目，邹挺，主持，2020---2021。
2019年承担课题
1. 运用基因编辑技术提高稻米直链淀粉含量，国家教育部春晖计划，张红宇，主持，2019---2020。
2. 丘区高效稻、蔬水旱轮作模式的技术集成研究与试验示范，四川省科技厅重点研发，邓其明，主持，2019---2022。
3. 水稻抗纹枯病基因资源的搜集与利用（关键技术攻关项目），四川省科技厅重点研发，郑爱萍，主持，2019---2022。
4. 优质绿色糯稻及其糯米粉全产业链产业技术研究（企业创新能力培育），四川省科技厅重点研发，朱军，主持，2019---2022。
5. 富硒杂交糯稻在老挝的种植示范，四川省科技厅国际合作，陈荣军，主持，2019---2022。
6. 缅甸等一带一路国家水稻品种技术创新转移合作研究，四川省科技厅国际合作，刘怀年，主持，2019---2021。
7. 绿色优质杂交水稻新品种培育及商业化育种成果及孵化平台建设，四川省科技厅项目，徐培洲，参与，2019---2021。
8. 水稻MRBBR4调控稻瘟病广谱抗性的机理研究，四川省科技厅其它专项，李伟滔，主持，2019---2022。
9. 杂交水稻现代化制种技术研究与示范，四川省科技厅其它专项，廖泳祥，主研，2019---2020。
10. 中国好技术--糯稻绿色种植技术和糯米粉精深加工集成研究技术的应用，四川省科技厅其它专项，朱军，主持，2019---2020。
11. OsCIPK31调控水稻穗顶颖花发育的分子机理，其他省市项目，廖泳祥，主持，2019---2022。
12. 水稻长护颖基因LSL59的功能解析，其他省市项目，廖泳祥，主持，2019---2022。
13. 影响水稻花粉发育新基因HP1的克隆及功能研究，其他省市项目，邹挺，主持，2019---2021。
14. 四川省种子质量海南鉴定，现代农业发展工程专项，王玉平，主持，2019---2020。
2018年承担课题
1. SG3蛋白调控水稻株型和粒型的分子生物学功能研究，国家自然科学基金面上项目，李仕贵，主持，2018---2020。
2. MATE转运蛋白DGF1调控水稻灌浆的分子生物学功能研究，国家自然科学基金面上项目，钦鹏，主持，2018---2020。
3. 一个花时调控基因EMF1的鉴定和功能分析，国家自然科学基金面上项目，徐培洲，主持，2018---2020。
4. 转录因子DTF1调控稻瘟病抗性的分子机制，国家自然科学基金面上项目，李伟滔，主持，2018---2019。
5. 控制水稻穗型的遗传网络解析，国家自然科学基金重大研究计划，邓晓建，主持，2018---2019。
6. 超级稻增产基因的聚合及分子设计育种利用研究，国家自然科学基金重大研究计划，李仕贵，主研，2018---2019。
7. OsSTLs介导独脚金内酯运输调控水稻株型的遗传和分子机制，国家自然科学基金青年项目，梁越洋，主持，2018---2020。
8. 水稻垩白相关基因OsPK2的克隆与功能研究，国家自然科学基金青年项目，涂斌，主持，2018---2020。
9. 川南杂交中稻地力培肥和养分高效利用技术集成与示范，国家科技部国家重点研发计划，孙永健，主持子课题，2018---2020。
10. 课题-川南杂交中稻机械化丰产高效技术集成与示范（徐富贤），国家科技部粮食丰产科技工程，马均，课题主持，2018---2020。
11. 国家水稻产业体系长江上游栽培技术试验与示范，国家农业部产业技术体系，马均，主持，2018---2022。
12. 优质稻产业技术创新团队创建及产业链技术集成示范，四川省科技厅重点研发，邓其明，主持，2018---2021。
13. 杂交水稻骨干亲本叶片保绿相关基因LTN3的功能解析，四川省科技厅应用基础，廖泳祥，主持，2018---2021。
14. 三种不同颜色稻米中涉及类黄酮调控网络通路的差异表达分析，四川省科技厅应用基础，陈晓琼，主持，2018---2020。
15. 富硒红糯米杂交稻及其深加工技术的研发，四川省科技厅国际合作，朱建清，主持，2018---2020。
16. 优质绿色杂交水稻新品种培育，四川省科技厅重大科技专项，梁越洋，主研，2018---2020。
17. 糯稻绿色生产技术集成及其产品产业化应用与研究（示范基地），四川省科技厅科技扶贫专项，朱军，主持，2018---2020。
18. 稻虾综合种养技术创新与运用推广，四川省科技厅科技扶贫专项，邓其明，主持，2018---2019。
19. 作物生理生态及栽培四川省重点实验室，四川省科技厅条件平台，马均，主持，2018---2020。
20. 农村农业部重大计划协同推广计划，四川省农业厅其它专项，孙永健，主研，2018---2020。
21. 水稻抽穗整齐度测定方法优化及其与群体质量的关系研究，四川省教育厅重点项目，杨志远，主持，2018---2020。
22. 优质抗倒伏型杂交稻新品种内6优538配套技术，四川省教育厅重大培育，王玉平，主持，2018---2020。
23. 一个新的水稻育性控制基因的克隆及功能分析，其他省市项目，李双成，主持，2018---2019。
24. 邛崃现代农业合作，邛崃市政府，朱军，主持，2018---2020。
2017年承担课题
1. 高光效水稻育种技术体系的构建，国家科技部国家重点研发计划，邓晓建，主持子课题，2017---2020。
2. 课题-高光效、高配合力、高品质杂交水稻骨干亲本创制（任光俊），国家科技部国家重点研发计划，李平，课题主持，2017---2020。
3. 课题-水稻多元化种植水肥耦合高效利用规律及协同调控机制研究（杨文钰），国家科技部国家重点研发计划，杨志远，课题主持，2017---2020。
4. 农作物病虫鼠害疫情监测与防治项目，国家农业部其它专项，徐培洲，主持，2017---2018。
5. 水稻抗性资源发掘与骨干亲本遗传改良，国家其他部委其他项目，李伟滔，主持，2017---2020。
6. 一个水稻雄性不育基因的克隆，国家其他部委其他项目，李双成，主持，2017---2018。
7. 健康保健型糯米粉的研发及其精深加工技术集成研究，四川省科技厅重点研发，朱军，主持，2017---2020。
8. 基于CRISPR/Cas9系统的糯稻育种新材料创制和新品种选育体系的构建，四川省科技厅应用基础，朱军，主持，2017---2019。
9. 引进老挝糯稻资源选育富硒红糯米杂交稻，四川省科技厅国际合作，李利华，主持，2017---2019。
10. 缅甸杂交稻新品种选育及有机种植产业化应用示范，四川省科技厅国际合作，李平，，2017---2018。
11. 蜀优217良种扩繁及配套生产技术，四川省科技厅科技成果转化，吴先军，主持，2017---2018。
12. 南繁公共实验室运行经费，四川省农业厅其它专项，李仕贵，主持，2017---2020。
13. 杂交水稻新品种新技术中试与示范，四川省农业厅其它专项，吴先军，主持，2017---2018。
14. 控制水稻籽粒镉积累基因的QTL定位及分析，四川省教育厅重点项目，陈薇兰，主持，2017---2019。
15. 一份水稻高垩白突变体的遗传分析与基因功能研究，四川省教育厅青年基金，涂斌，主持，2017---2019。
2016年承担课题
1. 油菜素内酯调控水稻株型与粒型的分子机制，国家自然科学基金重大研究计划，李仕贵，主持，2016---2018。
2. 水稻雌雄不育基因XF2的克隆及其控制减数分裂的机制，国家自然科学基金面上项目，李双成，主持，2016---2019。
3. 重穗型杂交稻骨干亲本抗倒基因OsXYN1的功能解析，国家自然科学基金面上项目，王玉平，主持，2016---2019。
4. 水稻转录因子ZFP3对稻瘟病害的分子调控，国家自然科学基金青年项目，李伟滔，主持，2016---2018。
5. 西南高光效水稻杂种优势利用技术与强优势杂交种创制，国家科技部国家重点研发计划，邓其明，参与，2016---2020。
6. 优质丰产杂交籼稻品种机直播适应性机理与筛选应，国家科技部国家重点研发计划，孙永健，主持子课题，2016---2020。
7. 西南稻区水稻功能基因鉴定和聚合分子设计育种，国家科技部国家重点研发计划，王玉平，主持，2016---2020。
8. 课题-优异等位基因聚合和高产新材料创制（傅向东），国家科技部国家重点研发计划，吴先军，课题主持，2016---2020。
9. 长江上游稻区抗虫转基因水稻新品种培育、新型安全抗虫转基因水稻材料的创制，国家农业部转基因专项，李平，参与，2016---2020。
10. “新株型超级稻”籼稻品种的培育，国家农业部转基因专项，李仕贵，参与，2016---2020。
11. 抗病转基因水稻新品种培育，国家农业部转基因专项，马炳田，主持子课题，2016---2020。
12. 水稻生产全程机械化栽培技术集成与示范，国家农业部产业技术体系，马均，主持，2016---2020。
13. 长江上游稻区超级杂交稻高效育种技术与新品种选育，国家农业部公益性行业科技，吴先军，参与，2016---2018。
14. 水稻早花时基因emf10的克隆与功能分析，四川省科技厅应用基础，徐培洲，主持，2016---2018。
15. 水稻高产提质与水肥高效利用栽培技术及其生理基础的研究，四川省教育厅重点项目，孙永健，主研，2016---2018。
16. 藏啤专用稻米新品种培育及技术集成与产业化示范，四川省科技厅科技支撑，邓其明，主持，2016---2017。
17. 四川省辐射诱变技术育种平台，四川省科技厅科技支撑，朱建清，主持，2016---2020。
18. 有利基因发掘及分子标记技术开发，四川省科技厅育种攻关，李平，主持，2016---2020。
19. 多抗杂交水稻新材料创制，四川省科技厅育种攻关，李仕贵，主持，2016---2020。
20. 突破性杂交稻新品种提质增效关键栽培技术研究—任务1，四川省科技厅育种攻关，马均，主持，2016---2020。
21. 超级杂交水稻新材料创制，四川省科技厅育种攻关，吴先军，主持，2016---2020。
22. 优质高产广适性杂交水稻的选育及示范推广，四川省科技厅育种攻关，徐培洲，主持，2016---2020。
23. 一个水稻灌浆延长和籽粒大小基因的克隆和功能研究，四川省科技厅国际合作，张红宇，主持，2016---2018。
24. 水稻基因资源的收集保存、基因发掘与特异种质创新，四川省科技厅育种攻关，徐培洲，主持，2016---2020。
25. 四川省农作物品种试验，四川省农业厅其它专项，马均，主持，2016---2020。
26. 南繁基地建设，四川省科技厅其它专项，李仕贵，主持，2016---2018。
2015年承担课题
1. 水稻生育后期早衰基因lps1的分子调控机制及利用，国家自然科学基金面上项目，邓晓建，主持，2015---2018。
2. 一个新的水稻显性大粒基因的图位克隆、功能分析和育种利用，国家自然科学基金面上项目，李平，主持，2015---2018。
3. 重穗型杂交稻骨干亲本千粒重和穗粒数基因SG1的功能解析，国家自然科学基金面上项目，李仕贵，主持，2015---2018。
4. PTB1控制水稻结实率的分子机制和调控网络，国家自然科学基金重大研究计划，李双成，主持，2015---2017。
5. 水稻线粒体损伤型黄化突变体d82的基因克隆及功能研究，国家自然科学基金青年项目，孙昌辉，主持，2015---2017。
6. 水稻纹枯病菌诱导水稻程序化死亡的作用机制，国家自然科学基金青年项目，郑爱萍，主持，2015---2017。
7. 特色优质稻新品种培育及全产业链技术集成与示范，四川省科技厅科技支撑，邓其明，主持，2015---2016。
8. 老挝糯稻种质资源的引进与利用，四川省科技厅国际合作，朱建清，主研，2015---2016。
9. 抗褐飞虱苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白cry基因研究及其杀虫活性区域分析，四川省科技厅，朱军，主持，2015---2017。
10. 一个水稻育性控制新基因的图位克隆、功能验证及调控途径，四川省杰出青年基金培育，李双成，主持，2015---2017。
11. 对小地老虎幼虫高效的Bt晶体蛋白的杀虫机理研究以及工程菌构建，高等学校博士学科点专项科研基金，朱军，主持，2015---2017。
2014年承担课题
1. 一个新的水稻穗粒数关键基因的遗传发掘、图位克隆及功能分析，国家自然科学基金重大研究计划，邓晓建，主持，2014---2016。
2. 水稻组蛋白甲基转移酶SDG724及互作基因调控抽穗期分子机制，国家自然科学基金面上项目，孙昌辉，主持，2014---2017。
3. 水稻二倍体和四倍体杂交的胚乳发育和印记基因分析，国家自然科学基金青年项目，张红宇，主持，2014---2016。
4. 控制水稻花药发育PHD-finger蛋白的功能研究，国家自然科学基金青年项目，钦鹏，主持，2014---2016。
5. 绿色超级稻新品种选育，国家科技部科技支撑 ，李仕贵，参与，2014---2018 。
6. 长江上游优质抗病种质创制与新品种选育，国家科技部科技支撑，王玉平，参与，2014---2018。
7. 聚合绿色性状基因选育重穗型杂交稻新品种，国家科技部“十二五”农村领域国家科技计划，马炳田，主研，2014---2018。
8. 水稻纹枯病关键致病分子机制研究，国家科技部973计划，郑爱萍，课题主持，2014---2017。
9. 一个控制水稻产量关键基因的发现及克隆，四川省科技厅应用基础，王平荣，主持，2014---2016。
10. 基于物联网技术的两系杂交稻选育平台及新品种培育和试验示范，四川省科技厅科技支撑，邓其明，主持，2014---2016。
11. 优质特色糯稻新品种培育及其稻米深加工产品研发与产业化应用，四川省科技厅科技支撑，朱军，主持，2014---2016。
12. 有色水稻花色素成分分析及其生理功能研究，四川省教育厅，陈晓琼，主持，2014---2016。
13. 一个控制水稻“源、库、流”基因的精细定位与克隆，四川省教育厅重点项目，钦鹏，主持，2014---2016。
14. 有色水稻营养成分分析及其生理功能研究与应用，成都市科技局国际合作项目，陈晓琼，主持，2014---2016。
15. 蓉18A基础研究 ，横向合作项目，陈荣军，主持，2014---2016。
2013年承担课题
1. 山兰稻干旱应答基因OsMSI-7 的功能研究，国家自然科学基金面上项目，徐正君，主持，2013---2016。
2. 国家杂交水稻重点实验室 ，国家科技部科技支撑，李平，参与，2013---2017 。
3. 四川盆地水稻丰产节水节肥技术集成与示范，国家科技部粮食丰产科技工程 ，马均，课题主持 ，2013---2017 。
4. 建立中国-孟加拉水稻联合研究中心，国家科技部科技部对发展中国家援助项目，朱建清，主持，2013---2015。
5. 本地与引进种质资源高效结合与利用研究，国家农业部公益性行业科技，李仕贵，参与，2013---2017。
6. 杂交水稻新品种川谷优204的试验示范，四川省科技厅科技成果转化，邓其明，主持，2013---2017。
7. 水稻低温诱导基因OsMSI3功能研究，四川省教育厅重点项目，李利华，主持，2013---2015。
8. 控制水稻花药发育PHD-finger蛋白的功能研究，杂交水稻国家重点实验室开放课题，钦鹏，主持，2013---2016。
2012年承担课题
1. 水稻联乙烯还原酶基因OsDVR的图位克隆与功能分析，国家自然科学基金面上项目，王平荣，主持，2012---2015。
2. 水稻水氮耦合与氮高效利用关系的研究，国家自然科学基金青年项目，孙永健，主持，2012---2015。
3. 同核异质水稻DNA甲基化和基因表达差异研究，国家自然科学基金青年项目，徐培洲，主持，2012---2014。
4. 长江上游水稻种质改良与创新利用，国家农业部创新团队，李仕贵，主持，2012---2016。
5. 水稻多逆境诱导基因OsMSI1 功能研究，国家教育部新教师基金，李利华，主持，2012---2014。
6. 水稻粒形粒重基因的发掘及利用，四川省科技厅科技支撑，邓晓建，主持，2012---2015。
7. 优质高产富硒杂交稻米生产示范及产业化，四川省科技厅科技支撑，朱建清，主持，2012---2014。
8. 防治稻瘟病的环境友好型生物农药的研发，四川省科技厅科技支撑，朱建清，主研，2012---2013。
9. 倍性水稻正反交后代胚乳中印记基因的表达和功能分析，四川省教育厅应用基础，张红宇，主持，2012---2014。
10. 高产优质杂交稻QL1637(Z优272)在东南亚国家示范推广，四川省科技厅科技成果转化，朱建清，主持，2012---2014。
11. 印度高产、优质、抗病虫玉米种质资源的引进与利用，四川省科技厅国际合作，朱建清，主持，2012---2013。
2011年以前（含）承担课题
1. 重穗型杂交稻的遗传改良与分子育种研究，国家杰出青年基金，李仕贵，主持，2011---2014。
2. 一个新的水稻黄化转绿标记基因的图位克隆，国家自然科学基金面上项目，邓晓建，主持，2011---2013。
3. 同源三倍体水稻基因组DNA甲基化研究，国家自然科学基金面上项目，吴先军，主持，2010---2012。
4. 影响水稻生育期的相关基因OsEF3的克隆和功能研究，国家自然科学基金 面上项目，李仕贵，主持，2010---2012。
5. 水稻显性早熟基因Ef-cd的克隆，国家自然科学基金面上项目，邓晓建，主持，2008---2010。
6. 几个特异基因家族在不同倍性水稻中的表达差异研究，国家自然科学基金面上项目，吴先军，主持，2008---2010。
7. 水稻完全显性早熟基因的遗传分析和分子标记定位，国家自然科学基金面上项目，邓晓建，主持，2001---2003。
8. 一个新类型水稻雌性不育基因PTBFS(t)的图位克隆，国家自然科学基金青年项目，李双成，主持，2009---2011。
9. 水稻骨干亲本遗传效应的基础研究及关键基因组区段，国家科技部973计划，李双成，主持子课题，2011---2015。
10. 盖茨基金，国家科技部，李仕贵 ，主持，2009---2012。
11. 高产优质杂交稻Z优272的产业化，科技部科技人员服务企业行动，朱建清，主持，2009---2011。
12. 两系杂交稻制种研究－产业技术联盟课题，国家科技部，李平，主持，2009---2011。
13. 蜀恢158系列杂交稻良种繁育与示范推广，国家科技部农转资金项目，吴先军，主持，2009---2010。
14. 主要农作物骨干亲本遗传效益与利用研究，国家科技部863计划，李平，主持，2008---2010。
15. 重穗抗倒型杂交稻蜀恢498系列组合的试验示范，国家科技部农业科技成果转化资金，李仕贵，主持，2008---2010。
16. 功能稻种质资源的搜集、引进、发掘与评价，国家科技部科技支撑，邓晓建，主持，2007---2010。
17. 富含有益微量元素的高产功能性杂交稻米研发与产业化，国家科技部科技支撑，朱建清，主持，2007---2010。
18. 主要粮食作物杂种优利用，国家科技部，李平，主持，2007---2010。
19. 骨干亲本形成的关键基因功能研究，国家科技部973计划，王世全，主持子课题，2006---2010。
20. 建立分子育种体系选育高产、优质、多抗杂交稻新组合，国家科技部863计划，李仕贵 ，主持，2006---2010。
21. 四川单季籼稻高效高产技术集成研究与示范，国家科技部科技支撑，马均，主持，2006---2010。
22. 水稻分子育种，国家科技部，李平，主持，2006---2010。
23. 在缅甸及东南亚国家建立水稻育种及推广基地，国家科技部国际科技合作，朱建清，主持，2006---2008。
24. 水稻稻瘟病、白叶枯病和纹枯病抗性基因多基因聚合研究，国家科技部863计划，邓其明，主持，2005---2010。
25. 优质、抗逆水稻种质资源与半致死突变剂的引进研究及杂种优势利用，国家科技部国际科技合作，朱建清，主持，2003---2006。
26. 长江上游一季超级杂交水稻选育研究，国家农业部，吴先军，主持，2010---2012。
27. 耐热基因TT1功能验证及其在水稻中育种价值分析，国家农业部转基因专项，吴先军，主研，2009---2010。
28. 西南地区抗水稻胁迫因子基因克隆与功能验证，国家农业部转基因专项，邓晓建，主持，2009---2011。
29. 长江上游抗病抗逆转基因重穗型杂交稳新品种培育，国家农业部转基因专项，李仕贵 ，主持，2009---2011。
30. 西南地区抗水稻胁迫因子基因克隆及功能验证，国家农业部转基因专项，吴先军，主研，2009---2011。
31. 南方早籼稻品质改良与抗逆栽培技术研究与示范，国家农业部，马均，主持，2008---2012。
32. 西南稻区现代水稻产业技术体系建设 ，国家农业部，马均，主持，2008---2012。
33. 长江上游稻区无选择标记转双价基因抗虫水稻新品种培育，国家农业部，李平，主持，2008---2011。
34. 新型杀虫基因的克隆研究，国家农业部，李平，主持，2008---2010。
35. 抗病虫关键基因克隆及功能验证，国家农业部，郑爱萍，主持，2008---2010。
36. 水稻分蘖相关基因ft1和Ext-M1B的克隆与应用研究，国家农业部转基因专项，邓其明，主持，2006---2010。
37. 水稻联乙烯还原酶基因OsDVR的功能分析与利用研究，国家教育部博士点基金，邓晓建，主持，2011---2013。
38. 利用倍性水稻研究印迹基因的功能及表达模式，国家引智项目，吴先军，主持，2010---2011。
39. 与全俄水稻研究所共同研发功能杂交稻米及其深加工技术，四川省科技厅国际合作，朱建清，主持，2010---2011。
40. 四川省高产优质杂交稻产业化，四川省科技厅科技支撑，朱建清，主持，2009---2010。
41. 水稻功能基因组研究，四川省科技厅应用基础，张红宇，主持，2007---2009。
42. 四川稻米品质的高效检测关键技术研究，四川省科技厅公益性研究计划，邓晓建，主持，2007---2009。
43. 水稻显性早熟基因Ef-cd的分子克隆与功能解析，四川省科技厅科技支撑，邓晓建，主持，2006---2010。
44. 省科技厅作物育种攻关-栽培，四川省科技厅育种攻关，马均，主持，2006---2010。
45. 省科技厅作物育种攻关-水稻育种，四川省科技厅 育种攻关，李仕贵 ，主持，2006---2010。
46. 红米色素基因的克隆、表达与保健杂交水稻新组合的选育，四川省科技厅科技支撑，朱建清，主持，2006---2008。
47. 保健杂交稻选育与红米色素基因的精细定位，四川省科技厅国际合作，朱建清，主持，2006---2008。
48. 省财政厅产业技术体系建设，四川省农业厅其它专项，李仕贵 ，主持，2009---2014。
49. 茶陵野生稻耐寒基因orct功能研究，四川省教育厅重点项目 ，陈荣军，主持，2011---2014。
50. 一个水稻叶色黄转绿标记新基因的图位克隆，四川省教育厅重点项目，王平荣，主持，2010---2013。
51. 一个水稻钙调素结合蛋白基因功能 ，四川省教育厅青年基金，李利华，主持，2010---2012。
52. 水稻不同倍性表达基因的DNA甲基化遗传模式研究，四川省教育厅应用基础，张红宇，主持，2009---2011。
53. 水稻雄性不育突变体XS1的形态特征、基因定位和分子克隆，四川省教育厅，李双成，主持，2009---2011。
54. 富含有益微量元素的功能稻种质资源的搜集、引进、发掘及其杂交稻的选育，成都市科技局科技攻关计划，朱建清，主研，2009---2010。
55. 玉米高产基因的克隆及转基因研究 ，横向合作项目，陈荣军，主持，2010---2010。
56. 四川农业大学博士专项基金，陈荣军，主持，2010---2011。
57. 淫羊藿和枸杞中的重要基因功能研究，中国科学院知识创新工程重要方向项目，陈荣军，主持，2007---2009。
58. 水稻耐旱分子机理研究，中国科学院知识创新工程领域前沿项目，陈荣军，主持，2005---2007。
59. 重穗型杂交稻在亚太地区的推广与应用，财政部亚太地区合作项目，朱建清，主持，2003---2006。
60. 优质早籼水稻育系的选育，四川省青年科技基金项目，朱建清，主持，2003---2006。
61. 斯里兰卡优质高抗水稻种质资源的引进、利用，四川省青年基金项目，朱建清，主持，2001---2003。